2013年清华大学计划招收本科生3372人，与去年持平。按照“优化生源结构，促进教育公平”的原则，在保持全国各省招生计划总量相对稳定的同时，重点将招生计划向高等教育欠发达且生源数量相对较多、升学压力较大的地区倾斜。

6月14日，清华柴继杰教授等在《科学》在线发表论文，首次报道了小鼠NOD样受体NLRC4自抑制状态的晶体结构，并通过结构分析和生化实验揭示了该蛋白维持自抑制作用的分子机制，这也是NOD样受体家族中首个被解析出的近乎全长的蛋白质晶体结构。

6月3日，由清华大学组织召开的大规模在线教育论坛在主楼举行，来自清华、北大、北师大、复旦等近30所高校的专家出席论坛。教育部党组成员、部长助理林蕙青到会并讲话。清华校长陈吉宁做大会主题报告。

5月30日，清华大学教书育人研讨会30周年师德论坛在主楼举行。中国教科文卫体工会主席万明东，北京市教育工会主席史利国，清华大学党委书记胡和平，党委副书记、工会主席韩景阳，副校长袁驷出席论坛。韩景阳主持论坛。

5月25日上午，张维教授百年诞辰纪念座谈会在清华主楼接待厅举行。张维是我国著名的结构工程、固体力学专家，高等工程教育家，科技教育活动家，两院院士，瑞典皇家工程科学院外籍院士，清华大学教授，清华大学原副校长、深圳大学原校长。