自主设立机构

清华大学国家治理研究院

清华大学智能法治研究院

清华大学国际争端解决研究院

清华大学公益慈善研究院

清华大学中国发展规划研究院

清华大学中国社会风险评估研究中心

清华大学科技发展与治理研究中心

清华大学互联网治理研究中心

清华大学投融资政策研究中心

清华大学中国科技政策研究中心

清华大学服务经济与数字治理研究院

清华大学国情研究院

清华大学产业发展与环境治理研究中心

清华大学纪检监察研究院

清华大学台湾研究院

清华大学区域发展研究院

清华大学全球可持续发展研究院

清华大学21世纪发展研究院

清华大学中国农村研究院

清华大学青少年德育研究中心

清华大学工程教育研究中心

清华大学金融科技研究院

清华大学国家金融研究院

清华大学全球贸易与产业竞争力研究中心

清华大学中国经济研究中心

清华大学中国财政税收研究所

清华大学中国现代国有企业研究院

清华大学国有资产管理研究院

国家统计局-清华大学数据开发中心

清华大学二十国集团创业研究中心

清华大学中国企业成长与经济安全研究中心

清华大学产业创新与金融研究院

清华大学全球共同发展研究院

清华大学中国经济社会数据研究中心

清华大学绿色经济与可持续发展研究中心

清华大学全球证券市场研究院

清华大学全球私募股权研究院（第二期）

清华大学互联网产业研究院（二期）

清华大学可持续社会价值研究院

清华大学中共党史党建研究院

清华大学张仃艺术研究中心

清华大学吴冠中艺术研究中心

清华大学奥林匹克艺术研究中心

清华大学艺术与科学研究中心

清华大学中国古文字艺术研究中心

清华大学韩美林艺术研究中心

清华大学人文与社会科学高等研究所

清华大学马克思恩格斯文献研究中心

清华大学中国经学研究院

清华大学文学创作与研究中心

清华大学道德与宗教研究院

清华大学数字政府与治理研究院

清华大学华商研究中心

清华大学科学技术与社会研究中心

清华大学新质生产力研究院

中国科协-清华大学科技传播与普及研究中心

清华大学老龄科学研究中心

清华大学社会治理与发展研究院

清华大学战略与安全研究中心

清华大学国际关系研究院

清华大学创新发展研究院

清华大学中国经济思想与实践研究院

清华大学一带一路战略研究院

清华大学全球产业研究院

清华大学体育发展研究院

清华大学体育与健康科学研究中心

清华大学世界文学与文化研究院

清华大学方塘研究院

清华大学新华国际传播研究院

清华大学马克思主义新闻学与新闻教育改革研究中心

清华大学伊斯雷尔•爱泼斯坦研究中心

清华大学国家形象传播研究中心

清华大学影视传播研究中心

清华大学文化创意发展研究院