周培源应用数学研究中心

Zhou Pei-Yuan Center for Applied Mathematics

“周培源应用数学研究中心”海外学者短期讲学课程通知

“周培源应用数学研究中心”海外学者短期讲学课程

Short term class of oversea scholar at Zhou Pei-Yuan Center for Applied Mathematics
 
课程名称(Class name):Physics and mathematics of macromolecules dynamics and diffusion in biology /生物学中大分子动力学和扩散现象的数学物理原理
课程编号:Y0490041(1学分,英文授课,考查)
授课人:Professor Francesco Piazza,  University of Orléans, France
授课语言:英文 English  考核方式:考查    学时:16  (1学分)       
授课地点:科学馆118教室 (Science Building, Room 118)
上课和讨论时间 (Time):
11月19日(周二) 19:20 – 20:55
11月20日(周三) 13:30 – 15:05
11月21日(周四) 19:20 – 20:55
11月22日(周五) 19:20 – 20:55
11月25日(周一) 19:20 – 20:55
11月26日(周二) 19:20 – 20:55
11月27日(周三) 13:30 – 15:05
11月28日(周四) 19:20 – 20:55
 
授课对象:研究生,高年级本科生。
课程负责人:孙卫涛(62796750)
 
选课方式:
即日起接受报名。请准备选课的同学在11月15日之前将“学号”“姓名”“所在院系”“联系电话”“电子邮件”等信息发送至sunwt@mails.tsinghua.edu.cn,邮件请注明“选课申请”。
 
欢迎校内外师生参加!
 
课程简介:
 
该课程旨在涵盖一些生物物理学的重要的问题。课程从描述的生物大分子的基本结构开始,然后将介绍其动力学性质和计算方法,这些方法常常被物理学家和化学家用来探索大分子结构、动力学和生物功能之间微妙的联系。
课程的第二部分专门用于讲授扩散作用以及扩散过程在细胞生物学中发挥得作用,课程将介绍生物学中解决扩散现象和Smoluchowski方程的基本数学方法。
课程的最后部分将涵盖重要的热力学概念及其在生物过程中的作用,特别是熵力的概念。
在完成课程的三个主要部分后,学生将学会处理简单而重要的练习题,以及运行简单的蛋白质动力学粗粒度模型计算机模拟。
 
 
 
Class introduction
These lectures are intended to cover some important problems in biological physics. It will start from the description of the basic building blocks of biological macromolecules, then move on to their dynamical properties and the computational methods that physicists and chemists employ to explore the subtle link between their structure, dynamics and biological function. The second part of the lectures is devoted to diffusion and the role of diffusion-related processes in cell biology. These lectures  will cover the basic mathematical methods used to solve the diffusion and the Smoluchowski equations in biologically relevant situations. The last lectures will cover important thermodynamic concepts and their role in biological processes, notably the concept of entropic forces. Two tutorial sessions will complete the course, allowing the students to tackle simple yet important exercises as well as to run simple computer simulations of coarse-grained models of protein dynamics .
 
周培源应用数学研究中心
研究生院
2013-11-05